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Lagarrigue, Sandrine
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Article A minimal model for hepatic fatty acid balance during fasting: Application to PPAR alpha-deficient mice   Blavy, Pierre ; Gondret, Florence ; Guillou, Hervé ; Lagarrigue, Sandrine ; Martin, P.G.P. ; van Milgen, Jaap ; Radulescu, Ovidiu ; Siegel, Anne
Journal of Theoretical Biology, 2009 , Volume 261 , n° 2 , 266-278 p.     [ ISSN : 0022-5193 ]


MODELISATION ; METABOLISME ; ACIDE GRAS ; NUTRITION ANIMALE
MÉTABOLISME DES ACIDES GRAS  ; SOURIS KNOCKOUT  ; A JEUN ; FOIE ; FATTY ACID METABOLISM ; SYSTEMS BIOLOGY ; FASTING ; KNOCKOUT MICE ; MODELING
MUS MUSCULUS ; SOURIS
758556 : UMR Physiologie Environnement et Génétique pour l 'Animal et les Systèmes d'Elevage (UMR PEGASE) - Cote = Publication 2009

Article Using transcriptome profiling to characterize QTL regions on chicken chromosome 5   Le Mignon, Guillaume ; Désert, Colette ; Pitel, Frédérique ; Leroux, Sophie ; Demeure, Olivier ; Guernec, Grégory ; Abasht, Behnam ; Douaire, Madeleine ; Le Roy, Pascale ; Lagarrigue, Sandrine
BMC Genomics, 2009 , Volume 10:575 , n° 10 , 1-14 p.  


ANIMAL ; VOLAILLE ; POULET ; GENOMIQUE ; EXPRESSION DES GENES ; CHROMOSOME ; CHROMOSOME 5 ; QTL


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745995 : Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP) - Cote = 2009

Colloque Utilisation du transcriptome pour préciser la localisation d'un QTL responsable de la variabilité d'engraissement chez le poulet de chair ( 2009 ) Le Mignon, Guillaume ; Pitel, Frédérique ; Désert, Colette ; Leroux, Sophie ; Demeure, Olivier ; Guernec, Grégory ; Douaire, Madeleine ; Le Roy, Pascale ; Lagarrigue, Sandrine  
746845 : Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP) - Cote = 2009
CONGRES ; SAINT-MALO ; VOLAILLE ; POULET ; POULET DE CHAIR ; GENE CANDIDAT ; TRANSCRIPTOME ; GENOMIQUE ; GENETIQUE ; QTL ; ADIPOSITE
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Colloque A minimal and dynamic model for fatty acid metabolism in mouse liver ( 2008 ) Blavy, Pierre ; Gondret, Florence ; Guillou, Hervé ; Lagarrigue, Sandrine ; Martin, P. ; Radulescu, Ovidiu ; Siegel, Anne ; van Milgen, Jaap  
758962 : UMR Physiologie Environnement et Génétique pour l 'Animal et les Systèmes d'Elevage (UMR PEGASE) - Cote = Publication 2008
LIPIDE ; ACIDE GRAS ; METABOLISME ; MODELISATION  ; FOIE  ; NETWORK MODELLING ; DIFFERENTIAL MODEL ; FATTY ACID METABOLISM ; ABSTRACTION

Article Transcriptome profiling of the feeding-to-fasting transition in chicken liver   Désert, Colette ; Duclos, Michel ; Blavy, Pierre ; Lecerf, F. ; Moreews, François ; Klopp, Christophe ; Aubry, M. ; Herault, Frédéric ; Le Roy, Pascale ; Berri, Cécile ; Douaire, Madeleine ; Diot, Christian ; Lagarrigue, Sandrine
BMC Genomics, 2008 , Volume 9 , n° 611 , 19 p. p.     [ ISSN : 1471-2164 ]


TRANSCRIPTOME ; GENE ; EXPRESSION GENIQUE ; LIPIDE ; REGULATION
 FOIE
POULET ; GALLUS GALLUS
758479 : UMR Physiologie Environnement et Génétique pour l 'Animal et les Systèmes d'Elevage (UMR PEGASE) - Cote = Publication 2008

Colloque Modélisation multi-organes et multi-espèces du métabolisme des lipides ( 2007 ) Blavy, Pierre ; Siegel, Anne ; Radulescu, Ovidiu ; Gondret, Florence ; van Milgen, Jaap ; Morrews, F. ; Martin, P. ; Lagarrigue, Sandrine  
758999 : UMR Physiologie Environnement et Génétique pour l 'Animal et les Systèmes d'Elevage (UMR PEGASE) - Cote = Publication 2007
METABOLISME ; LIPIDE ; MODELISATION

Article Complex qualitative models in biology : a new approach   Veber, Philippe ; Le Borgne, Michel ; Siegel, Anne ; Lagarrigue, Sandrine ; Radulescu, Ovidiu
Complexus, 2006 , Volume 2 , 140-151 p.   UMR GENETIQUE ANIMALE [ ISSN : 1424-8492 ]
Résumé :
We advocate the use of qualitative models in the analysis of large biological
systems. We show how qualitative models are linked to theoretical differential
models and practical graphical models of biological networks. A new technique for analyzing qualitative models is introduced, which is based...


401987 : Bibliothèque générale de Rennes (Sciences animales) - Cote = UMR GENETIQUE ANIMALE

Article Fatness QTL on chicken chromosome 5 and interaction with sex   Abasht, Behnam ; Pitel, Frédérique ; Lagarrigue, Sandrine ; Le Bihan-Duval, Elisabeth ; Le Roy, Pascale ; Demeure, Olivier ; Vignoles, Florence ; Simon J ; Cogburn LA ; Aggrey SE ; Vignal, Alain ; Douaire, Madeleine
GENETICS. SELECTION. EVOLUTION., 2006 , Volume 38 , 297-311 p.   [ ISSN : 0999-193x ]
Résumé :
Quantitative trait loci (QTL) affecting fatness in male chickens were previously identified on chromosome 5 (GGA5) in a three-generation design derived from two experimental chicken lines divergently selected for abdominal fat weight. A new design, established from the same pure lines, produced...

401967 : Bibliothèque générale de Rennes (Sciences animales)

Article Mapping quantitative trait loci affecting fatness and breast muscle weight in meat-type chicken lines divergently selected on abdominal fatness   Lagarrigue, Sandrine ; Pitel, Frédérique ; Carre W ; Abasht, Behnam ; Le Roy, Pascale ; Neau A ; Amigues, Yves ; Sourdioux, Michel ; Simon J ; Cogburn LA ; Aggrey SE ; Leclercq, Bernard ; Vignal, Alain ; Douaire, Madeleine
Genet Sel Evol, 2006 , Volume 38 , 85-97 p.   [ ISSN : 0999-193X ]
Résumé :
Quantitative trait loci (QTL) for abdominal fatness and breast muscle weight were investigated in a three-generation design performed by inter-crossing two experimental meat-type chicken lines that were divergently selected on abdominal fatness. A total of 585 F2 male offspring from 5 F1 sires...

401123 : Bibliothèque générale de Rennes (Sciences animales) - Cote = UMR GA

Article Qualitative analysis of the relation between DNA microarray data and behavioral models of regulation networks   Siegel, Anne ; Radulescu, Ovidiu ; Le Borgne, Michel ; Veber, Philippe ; Ouy,J. ; Lagarrigue, Sandrine
BioSystems, 2006 , Volume 84 , n° 2 , 153-174 p.   [ ISSN : 0303-2647 ]
Résumé :
We introduce a mathematical framework that allows to test the compatibility between differential data and knowledge on genetic and metabolic interactions. Within this framework, a behavioral model is represented by a labeled oriented interaction graph; its predictions can be compared to...

401970 : Bibliothèque générale de Rennes (Sciences animales)

Article Topology and static response of interaction networks in molecular biology   Radulescu, Ovidiu ; Lagarrigue, Sandrine ; Siegel, Anne ; Veber, Philippe ; Le Borgne, Michel
Journal of the Royal Society Interface, 2006 , Volume 3 , n° 6 , 185-196 p.  
Résumé :
We introduce a mathematical framework describing static response of networks occurring in molecular biology. This formalism has many similarities with the Laplace-Kirchhoff equations for electrical networks. We introduce the concept of graph boundary and we show how the response of the biological...

401968 : Bibliothèque générale de Rennes (Sciences animales)

Article A gene-based radiation hybrid map of chicken microchromosome 14: Comparison to human and alignment to the assembled chicken sequence   Morisson, Mireille ; Leroux, Sophie ; Jiguet-Jiglaire, Carine ; Assaf, Sirine ; Pitel, Frédérique ; Lagarrigue, Sandrine ; Bardes, Suzanne ; Fève, Katia ; Faraut, Thomas ; Abasht, Behnam ; Milan, Denis ; Vignal, Alain
Genet Sel Evol, 2005 , n° 37 , 229-251 p.   [ ISSN : 0999-193X ]
Résumé :
We present a gene-based RH map of the chicken microchromosome GGA14, known to have synteny conservations with human chromosomal regions HSA16p13.3 and HSA17p11.2. Microsatellite markers from the genetic map were used to check the validity of the RH map and additional markers were developed from...

chicken / comparative mapping / radiation hybrids / microchromosome 14 / intrachromosomal rearrangement ; CHROMOSOME ; CONSERVATION ; GENETIQUE ; GENETIQUE ANIMALE ; RECHERCHE ; Synteny
401124 : Bibliothèque générale de Rennes (Sciences animales) - Cote = UMR GA

Colloque Sex by fatness QTL interaction with transgressive variation in fat and lean lines ( 2005 ) Abasht, Behnam ; Lagarrigue, Sandrine ; Pitel, Frédérique ; Le Bihan-Duval, Elisabeth ; Le Roy, Pascale ; Simon J ; Cogburn LA ; Aggrey SE ; Vignal, Alain ; Douaire, Madeleine  
401183 : Bibliothèque générale de Rennes (Sciences animales) - Cote = UMR GA
GENETIQUE ; Genomics ; QTL ; VARIATION

Article A high-resolution radiation hybrid map of chicken chromosome 5 and comparison with human chromosomes   Pitel, Frédérique ; Abasht, Behnam ; Morisson, Mireille ; Crooijmans, Richard P.M.A. ; Vignoles, Florence ; Leroux, Sophie ; Fève, Katia ; Bardes, Suzanne ; Milan, Denis ; Lagarrigue, Sandrine ; Groenen, Martien A. ; Douaire, Madeleine ; Vignal, Alain
BMC Genomics, 2004 , Volume 1 , n° 5 , 66 p.   [ ISSN : 1471-2164 ]
Résumé :
BACKGROUND: The resolution of radiation hybrid (RH) maps is intermediate between that of the genetic and BAC (Bacterial Artificial Chromosome) contig maps. Moreover, once framework RH maps of a genome have been constructed, a quick location of markers by simple PCR on the RH panel is possible....

CHROMOSOME ; Chromosomes ; Expressed Sequence Tags ; PCR
401095 : Bibliothèque générale de Rennes (Sciences animales) - Cote = UMR GA

Colloque Characterisation of quantitative trait loci affecting fatness on chicken chromosome 5 ( 2004 ) Abasht, Behnam ; Pitel, Frédérique ; Lagarrigue, Sandrine ; Le Bihan-Duval, Elisabeth ; Le Roy, Pascale ; Frederic H ; Vignal, Alain ; Simon J ; Cogburn LA ; Aggrey SE ; Douaire, Madeleine  
401181 : Bibliothèque générale de Rennes (Sciences animales) - Cote = UMR GA
CHROMOSOME

Colloque Characterisation of quantitative trait loci affecting fatness on chicken chromosome 5867 ( 2004 ) Abasht, Behnam ; Pitel, Frédérique ; Lagarrigue, Sandrine ; Le Bihan-Duval, Elisabeth ; Le Roy, Pascale ; Frederic H ; Vignal, Alain ; Simon J ; Cogburn LA ; Aggrey SE ; Douaire, Madeleine  
401182 : Bibliothèque générale de Rennes (Sciences animales) - Cote = UMR GA
CHROMOSOME

Article Genetic linkage and expression analysis of SREBP and lipogenic genes in fat and lean chicken   Assaf, Sirine ; Lagarrigue, Sandrine ; Daval, Stéphanie ; Sansom, Manuella ; Leclercq, Bernard ; Michel, Joël ; Pitel, Frédérique ; Alizadeh, Mehdi ; Vignal, Alain ; Douaire, Madeleine
Comparative Biochemistry and Physiology B Biochemistry and Molecular Biology, 2004 , Volume 4 , n° 137 , 433-441 p.   [ ISSN : 0305-0491 ]
Résumé :
To identify the genes directly responsible, through DNA polymorphism, for the difference in fatness observed between a lean and a fat chicken line, we studied five genes (ACL, ACC, FAS, ME, SCD1) encoding key enzymes involved in liver fatty acid synthesis and secretion. Genetic linkage was tested...

Adipose Tissue ; Alleles ; ANALYSIS ; Animals ; Base Sequence ; Biosynthesis ; CCAAT-Enhancer-Binding Proteins ; Chickens ; DNA ; DNA-Binding Proteins ; ENZYME ; ENZYMES ; Enzymology ; Fatty Acids ; Gene Expression Regulation ; GENES ; GENETIQUE ; Growth & dévelopment ; Linkage (Genetics) ; Liver ; Metaboslim ; Molecular Sequence Data ; Obesity ; RECHERCHE ; Research Support,Non-U.S.Gov't ; RNA ; RNA Processing,Post-Transcriptional ; RNA,Messenger ; SECRETION ; Secrétion ; Thinness ; TRANSCRIPTION ; Transcription Factors
401107 : Bibliothèque générale de Rennes (Sciences animales) - Cote = UMR GA

Colloque Réseaux d'ADNc pour l'analyse du transcriptome des animaux d'élevage ( 2004 ) Bonnet, Agnès ; Degrelle, Séverine ; Diot, Christian ; Douaire, Madeleine ; Guiguen, Yann ; Hatey, François ; Herault, Frédéric ; Hocquette, Jean-François ; Hue, Isabelle ; Lagarrigue, Sandrine ; Le Gac, Florence ; Leroux C ; Martin P ; Pollet S ; Renard JP ; Sandra, Olivier ; Tosser-Klopp, Gwenola  
401192 : Bibliothèque générale de Rennes (Sciences animales)
GENOMIQUE ; TRANSCRIPTOME

Colloque Réseaux d'ADNc pour l'analyse du transcriptome des animaux d'élevage. Programme AGENAE ( 2004 ) Bonnet, Agnès ; Degrelle, Séverine ; Diot, Christian ; Douaire, Madeleine ; Guiguen, Yann ; Hatey, François ; Herault, Frédéric ; Hocquette, Jean-François ; Hue, Isabelle ; Lagarrigue, Sandrine ; Le Gac, Florence ; Leroux, C. ; Martin, P. ; Pollet, S. ; Renard, J.P. ; Sandra, Olivier ; Tosser-Klopp, Gwenola  
744977 : Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP) - Cote = 2004
SEMINAIRE ; PARIS ; FRANCE ; ANIMAL D'ELEVAGE ; TRANSCRIPTOME ; GENOMIQUE AGENAE
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Article A functional approach to fattening in chickens   Bourneuf, Emmanuelle ; Herault, Frédéric ; Retout, Elodie ; Lagarrigue, Sandrine ; Douaire, Madeleine ; Diot, Christian
British Poultry Science, 2003 , Volume 44 , n° 44 , 793-794 p.   [ ISSN : 0007-1668 ]


Animals ; Chickens ; Comparative Study ; Gene Library ; GENETIQUE ; Growth & dévelopment ; Isolation & purification ; Liver ; Nucleic Acid Hybridization ; PHYSIOLOGY ; Polymerase Chain Reaction ; RNA ; Weight Gain
401096 : Bibliothèque générale de Rennes (Sciences animales) - Cote = UMR GA
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