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Guernec, Grégory
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Article A comprehensive evaluation of normalization methods for illumina high-throughput RNA sequencing data analysis   Dillies, M.A. ; Rau, A. ; Aubert, J. ; Hennequet-Antier, C. ; Jeanmougin, S. ; Servant, N. ; Keime, C. ; Marot, G. ; Castel, D. ; Estelle Fabrellas, J. ; Guernec, Grégory ; Jagla, B. ; Jouneau, L. ; Denis, L. ; Le Gall, C. ; Schaeffer, B. ; Le Crom, S. ; Guedj, M. ; Jaffrezic, F.
Brief. bioinform., 2013 , Volume 14 , n° 6 , 671-683 p.  




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746940 : Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP) - Cote = 2013

Article A unique in vivo experimental approach reveals metabolic adaptation of the probiotic Propionibacterium freudenreichii to the colon environment   Saraoui, Taous ; Parayre, Sandrine ; Guernec, Grégory ; Loux, Valentin ; Montfort, Jérôme ; Le Cam, A. ; Boudry, Gaëlle ; Jan, Gwénaël ; Falentin, Hélène
BMC Genomics, 2013 , Volume 14:911 , 1-15 p.  


GENOMIQUE


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746916 : Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP) - Cote = 2013

Colloque A unique in vivo experimental approach reveals metabolic adaptation of the probiotic Propionibacterium freudenreichii to the colon environment ( 2013 ) Parayre, Sandrine ; Saraoui, Taous ; Guernec, Grégory ; Loux, Valentin ; Montfort, Jérôme ; Le Cam, A. ; Boudry, Gaëlle ; Jan, Gwénaël ; Falentin, Hélène  
746 917 : Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP) - Cote = 2013
GENOMIQUE


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Article The GENCODE v7 catalog of human long noncoding RNAs: Analysis of their gene structure, evolution, and expression   Derrien, Thomas ; Johnson, Rory ; Bussotti, Giovanni ; Tanzer, Andrea ; Djebali, Sarah ; Tilgner, Hagen ; Guernec, Grégory ; Martin, David ; Merkel, Angelika ; Gonzalez, D. ; Lagarde, Julien ; Veeravalli, Lavanya ; Ruan, Xiaoan ; Ruan, Yijun ; Lassmann, Timo ; Carninci, Piero ; Brown, James B. ; Lipovich, Leonard ; Gonzalez, José-Manuel ; Thomas, Mark ; Davis, Carrie.A. ; Shiekhattar, Ramin ; Gingeras, Thomas R. ; Hubbard, Timothy John ; Notredame, Cédric ; Harrow, Jennifer ; Guigo, Roderic
Genome Res., 2012 , Volume 22 , n° 9 (SI) , 1775-1789 p.  


HOMME ; HUMAIN ; GENOME HUMAIN ; ANALYSE DU GENOME ; ANALYSE GENETIQUE ; EXPRESSION DES GENES ; TRANSCRIPTION ; MICROARRAY
GENCODE ; ENCODE


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746664 : Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP) - Cote = 2012

Article Transcriptomic profiling of the reproductive mode switch in the pea aphid in response to natural autumnal photoperiod   Le Trionnaire, Gaël ; Jaubert-Possamai, Stéphanie ; Bonhomme, Joël ; Gauthier, Jean-Pierre ; Guernec, Grégory ; Le Cam, A. ; Legeai, F. ; Montfort, Jérôme ; Tagu, Denis
J. Insect Physiol., 2012 , Volume 58 , 1517-1524 p.  


PLANTE ; VEGETAL ; LEGUME ; LEGUME A GRAINE ; POIS ; REPRODUCTION DES PLANTES ; MODE DE REPRODUCTION ; FACTEUR ENVIRONNEMENTAL ; GENOMIQUE ; GENE ; TRANSCRIPTION ; MICROARRAY ; PHOTOPERIODE


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746674 : Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP) - Cote = 2012

Colloque Etude de la fiabilité des listes de gènes différentiels obtenues à partir de données de comptage générées par séquençage 454 [Roche] en comparaison avec la technologie des microréseaux d'ADN [Agilent] ( 2011 ) Guernec, Grégory ; Montfort, Jérôme ; Le Cam, A. ; Reinhardt, R. ; Prunet, Patrick ; Guiguen, Yann ; Rescan, Pierre-Yves ; Power, D.  
746514 : Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP) - Cote = 2011
SEMINAIRE ; VERSAILLES ; FRANCE ; POISSON ; TRUITE ARC-EN-CIEL ; ONCHORYNCHUS MYKISS ; STATISTIQUE ; ANALYSE STATISTIQUE ; BIOINFORMATIQUE ; GENE ; TRANSCRIPTOME ; SEQUENCAGE ; MICROARRAY ; FIABILITE DES DONNEES ; COEFFICIENT DE CORRELATION


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Colloque Changes in the liver transcriptome induced by a plant based diet compared to a marine based diet in two lines of rainbow trout selected for muscle fat content ( 2010 ) Stubhaug, I. ; Corraze, Geneviève ; Kolditz, Catherine-Ines ; Kaushik, Sadasivam J. ; Guernec, Grégory ; Panserat, Stéphane ; Médale, Françoise  
746790 : Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP) - Cote = 2010
POISSON ; SALMONIDAE ; TRUITE ARC-EN-CIEL ; TRANSCRIPTOME ; EXPRESSION DES GENES ; FARINE DE POISSON ; NUTRITION ; NUTRITION ANIMALE ; HUILE VEGETALE ; PROTEINE ; PROTEINE VEGETALE


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Colloque Transcriptome analysis of different cell types in trout gill ( 2010 ) Leguen, Isabelle ; Péron, S. ; Montfort, Jérôme ; Le Cam, A. ; Guernec, Grégory ; Fautrel, Alain ; Prunet, Patrick  
746161 : Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP) - Cote = 2010
CONGRES ; BARCELONE ; POISSON ; SALMONIDAE ; TRUITE ARC-EN-CIEL ; ONCORHYNCHUS MYKISS ; TRANSCRIPTOME ; EXPRESSION DES GENES ; BRANCHIE ; SALINITE ESPAGNE
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Article Transcriptomic analysis of intestinal genes following acquisition of pea enation mosaic virus by the pea aphid Acyrthosiphon pisum   Brault, Véronique ; Tanguy, Sylvie ; Reinbold, C. ; Le Trionnaire, Gaël ; Arneodo, J. ; Jaubert-Possamai, Stéphanie ; Guernec, Grégory ; Tagu, Denis
J. Gen. Virol., 2010 , Volume 91 , 802-808 p.  


PLANTE ; VEGETAL ; LEGUME ; LEGUME A GRAINE ; POIS ; ACYRTHOSIPHON PISUM ; GENOMIQUE ; GENE ; TRANSCRIPTION ; VIRUS


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746064 : Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP) - Cote = 2010

Article Effect of wheat roots infected with the pathogenic fungus Gaeumannomyces graminis var. tritici on gene expression of the biocontrol bacterium Pseudomonas fluorescens Pf29Arp   Barret, M. ; Frey-Klett, P. ; Guillerm-Erckelboudt, A.Y. ; Boutin, M. ; Guernec, Grégory ; Sarniguet, Alain
Mol. Plant. Microbe Interact., 2009 , Volume 22 , n° 12 , 1611-1623 p.  


PLANTE ; GRAMINE ; GAEUMANNOMYCES GRAMINIS VAR. TRITICI ; BACTERIE ; PSEUDOMONAS FLUORESCENS ; CHAMPIGNON PHYTOPATHOGENE ; TRANSCRIPTOME ; EXPRESSION DES GENES ; ANTAGONISME


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745988 : Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP) - Cote = 2009

Colloque Mineralocorticoid receptor in fish: appraisal of its osmoregulatory role ( 2009 ) Prunet, Patrick ; Kiilerich, P. ; Milla, Sylvain ; Houeix, B. ; Valotaire, Claudiane ; Guernec, Grégory ; Leguen, Isabelle  
745957 : Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP) - Cote = 2009
CONGRES ; HONG KONG ; CHINE ; POISSON ; POISSON OSSEUX ; SALMONIDAE ; TRUITE ARC-EN-CIEL ; ONCORHYNCHUS MYKISS ; ADAPTATION ; STRESS ; OSMOREGULATION ; SALINITE ; HORMONE ANIMALE ; RECEPTEUR D'HORMONE ; CORTICOSTEROIDE ; GLUCOCORTICOIDE ; MINERALOCORTICOIDE ; EXPRESSION DES GENES ; CORTISOL ; 11-DEOXYCORTICOSTERONE (DOC) ; BALANCE HYDROMINERALE


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Colloque Use of functional genomic information as operational welfare indicators: critical assessment and possible future ( 2009 ) Prunet, Patrick ; Mativet, S. ; Le Borgne, G. ; Guernec, Grégory ; Montfort, Jérôme ; Auperin, Benoît  
746233 : Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP) - Cote = 2009
CONGRES ; ISLANDE


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Article Using transcriptome profiling to characterize QTL regions on chicken chromosome 5   Le Mignon, Guillaume ; Désert, Colette ; Pitel, Frédérique ; Leroux, Sophie ; Demeure, Olivier ; Guernec, Grégory ; Abasht, Behnam ; Douaire, Madeleine ; Le Roy, Pascale ; Lagarrigue, Sandrine
BMC Genomics, 2009 , Volume 10:575 , n° 10 , 1-14 p.  


ANIMAL ; VOLAILLE ; POULET ; GENOMIQUE ; EXPRESSION DES GENES ; CHROMOSOME ; CHROMOSOME 5 ; QTL


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745995 : Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP) - Cote = 2009

Colloque Utilisation du transcriptome pour préciser la localisation d'un QTL responsable de la variabilité d'engraissement chez le poulet de chair ( 2009 ) Le Mignon, Guillaume ; Pitel, Frédérique ; Désert, Colette ; Leroux, Sophie ; Demeure, Olivier ; Guernec, Grégory ; Douaire, Madeleine ; Le Roy, Pascale ; Lagarrigue, Sandrine  
746845 : Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP) - Cote = 2009
CONGRES ; SAINT-MALO ; VOLAILLE ; POULET ; POULET DE CHAIR ; GENE CANDIDAT ; TRANSCRIPTOME ; GENOMIQUE ; GENETIQUE ; QTL ; ADIPOSITE
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Colloque Recherche de gène(s) associé(s) au caractère de résistance à un stress de salinité par une approche de type QTL d'expression chez la truite arc-en-ciel Oncorhynchus mykiss ( 2008 ) Le Bras, Yvan ; Prunet, Patrick ; Le Roy, Pascale ; Guernec, Grégory  
745639 : Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP) - Cote = 2008
RENNES ; FRANCE ; THESARD ; POISSON ; POISSON OSSEUX ; SALMONIDAE ; TRUITE ARC-EN-CIEL ; ONCORHYNCHUS MYKISS ; ADAPTATION ; STRESS ; RESISTANCE AU STRESS ; SALINITE ; BRANCHIE ; MORTALITE ; EXPRESSION DES GENES ; MARQUEUR GENETIQUE ; OSMOREGULATION ; EAU DE MER ; EAU DOUCE


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